目前蛋白质化学合成研究中,固相合成方法是最常用也是最简便的方法，该方法在合成长链多肽时同样效果显著，但是随着肽链的延长，反应会逐渐变得更难进行（比如大于150个氨基酸），随着序列的增长，缩合反应空间位阻增大，为了反应完全， 需要增加反应时间；但是随着反应时间的延长，其产生的副反应就越多， 一些缺残基的目标肽就随之产生。
这些缺残基的肽链也是 长肽合成过程中所产生的主要杂质。 因此，长肽的合成过程中，我们需要克服的主要困难是探索更优质的反应条件和反应方法， 从而使氨基酸缩合反应进行的更充分更彻底。同时缩短反应时间，因为反应时间越长，不可 控的副反应相对的就越多，副产物就越复杂。
我们经过多年的摸索与积累，总结出以下经验：
(1)采用微波合成法：对于合成过程中出现的一些难以缩合的氨基酸，我们采用微波法进 行合成，该方法效果显著，并且大大缩短了反应时间，同时减少了两种主要副产物的 产生。
(2)采用片段合成法：当某些多肽用常规合成方法合成困难，并且难以纯化时，我们也会 采用将多肽中某一段的某几个氨基酸缩合之后作为一个整体缩合到肽链上去，这种方 法也能够解决许多合成中存在的问题。
(3)采用酰肼合成法：酰肼法合成多肽的方法是固相合成的N 末端Cys 多肽和C 末端多肽 酰肼之间的化学选择性反应形成酰胺键而实现多肽连接的方法。该方法根据肽链中 Cys的位置，将整条肽链分成多条序列分别合成，最终经过液相合缩反应得到目标肽， 该方法不仅大大缩短了长肽合成时间，而且显著地提高了最终产物纯度，因此广泛适 用于含有Cys的长链多肽的合成。
